En la comuna de Panguipulli existen numerosos humedales, un humedal se define como “extensiones de marismas, pantanos y turberas, o superficies cubiertas de agua”, sean estas de régimen natural o artificial, permanentes o temporales, estancadas o corrientes, dulces, incluidas las extensiones de agua marina, cuya profundidad en marea baja no exceda de seis metros”, según la Convención Internacional de Ramsar, en la cual 168 países, incluido Chile, han firmado un tratado de conservación de humedales desde 1971 y donde hay catastrados más de 2.100 sitios en todo el mundo. Los humedales están en constante amenaza y desde el año 1900 ha desaparecido el 64% de ellos. Algunas de las principales causas son los grandes cambios en el uso de la tierra por el aumento de la agricultura y el pastoreo; la derivación de agua mediante represas, diques y canalizaciones; el desarrollo de infraestructuras, particularmente en zonas urbanas, valles fluviales y zonas costeras; el ingreso de vehículos sin autorización y los perros asilvestrados, que se comen los huevos de las aves.